El Foro Marítimo Vasco está Gobernado por la Junta Directiva en la que se encuentran representados tanto Empresas como Instituciones, Banca, Administración, Organismos y Asociaciones del Sector, que se reúne 2-3 veces al año con carácter general, para establecer y revisar el Plan de Acción del FMV y sus ejes estratégicos.